La Ley de 1883 de construcción del Ferrocarril Central Entrerriano comprendía la diagramación de los ramales partiendo desde Paraná, pasando por Nogoyá y alcanzando Rosario del Tala, para desde allí salir hacia Villaguay y Concordia por el norte,  y Concepción del Uruguay por el este. Pero este proyecto fue desechado por inconvenientes técnicos, dando paso a la contingencia.

Como debido a la autonomía de las locomotoras de la época se construían estaciones cada 10 o 15 kilómetros, finalmente se decidió que los ramales para el norte, el este y el nuevo para el sur (hacia Gualeguaychú) se iniciaran en una Estación ubicada en el Km.222,445 denominándose a la misma “Gobernador Basavilbaso”, en honor a Clemente Basavilbaso, entonces en funciones.

Nacida tras el paso del tren el 30 de junio de 1887, Basavilbaso fue, al igual que tantas otras localidades del interior, una Estación Ferroviaria a la vera de la cual se asentaran grupos inmigrantes, en este caso de origen judío.

Fue ésta la primera colonia judía llegada al país, y fue también la impulsora de la primera Cooperativa Agrícola Sudamericana, llamada Lucienville. Como “gauchos judíos” fueron conocidos estos pioneros que desarrollaron la agricultura y la cría de animales en un espacio donde estas actividades eran prácticamente inexistentes.

Posteriormente se asentaron familias de otros orígenes: italianas, rusas y alemanas del Volga convirtiendo a Basavilbaso en una verdadera “zona de inmigrantes”. El desarrollo habitacional creó la necesidad de organizarse de acuerdo a las leyes de la época. Los primeros datos que se conservan datan de 1916, cuando un censo registra 2048 habitantes, creándose por decreto del 5 de mayo de 1917 “La Junta de Fomento”.

El ferrocarril se encontraba desde 1892 en manos de la firma "The Entre Ríos Railways Company Ltd.", de capitales ingleses; y en 1921 la estación es trasladada a su actual emplazamiento, construyéndose el Galpón de Máquinas para mantenimiento y reparación, y convirtiéndose a Basavilbaso en centro polarizador del tránsito ferroviario a nivel provincial y regional.

Otro censo realizado en 1938, recogiendo un total de 6638 habitantes, conduce a la Estación hacia la categoría de Ciudad y Municipio de Primera. Así, Basavilbaso crecía mientras lo hacía el Ferrocarril y se afianzaban los colonos. Un hecho que demuestra que la vida de la ciudad se encontraba atada a los trenes y sus trabajadores, es el estancamiento provocado ante el cierre de los ramales.